این موزه در محل سازمان زمین‌شناسی در میدان آزادی ساخته شده است. ساختمان موزه یك طبقه با بخش‌های گوناگون است. این بخش‌ها شامل آثار زیر است : سنگ‌های كانی، آثار فسیلی، آثار باستان‌شناسی مربوط به هشتصد سال پیش، فسیل‌های دوران اول تا چهارم زمین‌شناسی، ماكت فسیل‌های كم‌یاب، تخم‌‌های دایناسور كه از مرز فرانسه و اسپانیا آورده شده، فسیل جای پای دایناسور كه از استان كرمان به این موزه آورده شده است. همچنین كانی‌های قیمتی نظیر فیروزه، الماس و سنگی كه گویا نیل آرمسترانگ از كره ماه به زمین آورده و در زمان رژیم سابق به ایران اهدا شد، در این موزه قرار گرفته است.